پاورپوینت ترمودینامیک 2 کلیات و تعاریف (pptx) 33 اسلاید
دسته بندی : پاورپوینت
نوع فایل : PowerPoint (.pptx) ( قابل ویرایش و آماده پرینت )
تعداد اسلاید: 33 اسلاید
قسمتی از متن PowerPoint (.pptx) :
ترمودینامیک 2
کلیات و تعاریف
1
مروری بر گرماسنجی روبشی تفاضلی (DSC)
2
کالریمتری (گرماسنجی) تیتراسیونی همدما (ITC)
ترمودینامیک برهمکنش مولکولها در محلول را میتوان با گرماسنجی تیتراسیونی همدما اندازه گرفت.
دستگاه ITC خیلی شبیه DSC است. اما در این مورد به جای تغییر دما نمونه (و شاهد) در دمای ثابت نگاه داشته میشوند (همدما). سل نمونه دارای سرنگ تزریقی که مقادیر جزئی محلولی دیگر (مثلا لیگاند) را با نمونه مخلوط میکند.
معمولا بدین طریق میتوان گرمای اتصال دارو و یا مولکول مهار کننده به آنزیم را اندازه گرفت.
3
طراحی دستگاه گرماسنجی تیتراسیونی همدما (ITC)
شبیه DSC
روشی مستقیم
اما به جای تغییر دما، مرجع و نمونه در دمای ثابت
تیتراسیون توسط سرنگ توخالی مجهز به ریز پروانه
اندازه گیری حرارت ناشی از تزریقات (تیتراسیون)
مطالعه اتصال دارو، مهارکننده به آنزیم
4
مطالعه ITC مهار لیزوزیم توسط تری-NAG
شرایط واکنش
3-dm mol 0/1 بافر اتانووات 7 pH
µL 10 تری-NAG (3-dm mmol 0/45)
به محلول پروتئین (3-dm µmol 36)
دادههای به دست آمده:
استوکیومتری اتصال
0/99= N
تمایل اتصال
1-(3-dm mol)105× 3/9= اتصال K
3-dm µmol 2/6= تفکیک K
آنتالپی اتصال (پیوند)
1-mol kJ 51/7- = DH
5
دادههای گرماسنجی تیتراسیونی همدما (ITC)
در ابتدا، با هر تزریق پالسهای گرمایی خیلی بزرگی دیده میشود.
این گرمای زیاد مرتبط با انرژی حرارتی آزاد شده به هنگام اتصال مولکول مهارکننده با جایگاه فعال پروتئین است.
اما با تزریقات متوالی، پالسهای گرمایی کوچکتر میشوند تا جایی که تمامی جایگاههای فعال در دسترس اشغال شوند.
تطبیق به مدل (اینجا تک جایگاهی)
دادههای به دست آمده:
استوکیومتری اتصال 0/99= N
تمایل اتصال 1-(3-dm mol)105× 3/9= اتصال K
3-dm µmol 2/6= تفکیک K
آنتالپی اتصال (پیوند) 1-mol kJ 51/7- = DH
6
تعادل اتصال
فرض کنیم که ثابت اتصال برای اتصال یک لیگاند به پروتئین را میدانیم. چگونه بدانیم که تحت یک شرایط خاص چقدر متصل میشود؟
عموما غلظت پروتئین کل و غلظت متصل شونده (لیگاند) را میدانیم، اما چه مقدار متصل میشود؟
برای اتصال لیگاند-پروتئین (یا هر مورد معادل):
ثابت تفکیک برابر است با:
7
تعادل اتصال (ادامه)
غلظت کل لیگاند (متصل شونده) عبارت خواهد بود از:
غلظت کل پروتئین برابر است با:
با استفاده از رابطه ثابت تعادل غلظت کل پروتئین عبارت خواهد بود از:
با استفاده از غلظت لیگاند کل در رابطه بالا:
8
تعادل اتصال در غیاب تعاونی و برهمکنشهای آلوستریک
باز آرایی این معادله، معادله درجه دوم برای [PL] را به دست میدهد:
که دو جواب دارد:
با مشاهده در مییابیم که علامت منفی از لحاظ فیزیکی صحیح است، عبارت دقیق برای تشکیل کمپلکس پروتئین لیگاند، [PL]، به عنوان تابعی از غلظت پروتئین و لیگاند کل عبارتست از:
9